章太炎主持《民报》后，章先后曾要求罢免孙中山同盟会总理职务，直到孙中山逝世后还写联挖苦。因此，很多文章认为两人关系不好，后来国民党的很多人也认为章太炎“反孙”。
民国成立，章太炎被任为袁世凯政府东三省筹边使，提出了东北开发的建言。1913年夏，章太炎来到北京，后遭袁世凯下令软禁，他与夫人汤国黎的南北“两地书”印证了这段历史。
章太炎在政治上经历了戊戌变法、辛亥革命、二次革命、护法运动等直到抗日战争，在重大政治活动宣传上建有功勋。但他同时也是一个特立独行的人，嫉恶如仇、放言无忌、刚直不阿，几度遭受牢狱之灾、流亡海外吃尽苦头仍不改初衷。
沈建中研究辛亥革命人物发现，革命先驱有些性格偏于激进，以秋瑾、章太炎为代表。章太炎因书生气太重，才会作出一系列过激行为。他与孙的分歧也是在于革命的路径问题，不存在个人矛盾。
在第一大国推翻绵延两千多年的君主专制制度，这在一般人看来很艰巨、很复杂、代价巨大，它是一场大变革，其实辛亥革命又被视之为胜利快、代价小的革命运动。这完全打破了康有为“准备几十年甚至上百年的时间，牺牲几十万甚至是上百万颗脑袋”的预言。
沈建中认为：“作为“辛亥三杰”的章太炎利用《民报》发表了大量的文章，舆论宣传为辛亥革命起到极大的推波助澜作用。民心所向披靡，受章太炎思想启迪，清政府的无能激起了许多留学生的共鸣，以此成为推翻清朝政府主流力量。”
学术泰斗
章太炎作为一代国学泰斗，从20世纪初开始，章太炎思想研究领域涉足非常广，其包括政治、经济、国学、佛学、经学、史学，他的许多学术思想对后世影响深远而广泛。
无论是文字学、史学、佛学还是他的经学、子学、社会学等，他都能本着严谨科学的态度、不拘于旧法，以别具一格的视角，针对现实加以思考与研究，大胆地进行打破、比较、借鉴、重构，以弘扬国粹。
章太炎桃李遍布天下，黄侃、钱玄同、鲁迅、周作人……都是他早年的弟子，他们后来名誉中外。然而他擅长经学、小学、史学、文学，现代人又极难读懂，连鲁迅都常常读不懂他的文章。就连章太炎孙子章念驰也认为“在研究祖父章太炎的一个侧面可能就要十几年”。
章太炎对中医发展起了不可估量的作用，在近代中医史上占有非常重要的地位。
章太炎在被袁世凯软禁北京期间，因对抗清英雄张苍水极为敬重，当时就立下遗愿，死后与张苍水为邻居。1936年，章太炎逝世于苏州。中华人民共和国成立后，1955年的清明节，他的灵柩被安葬在西湖南屏山麓，实现了与张苍水比邻而居的愿望，从1956年起，章墓就是浙江省文物保护单位。
1988年，在章太炎墓前建立了章太炎纪念馆，设有序厅、革命事迹厅、国学泰斗厅，馆内收藏有1000余件文物，其中以邹容的《流血革命》及《訄书》、《膏兰室札记》等章太炎手稿和书法真迹最为珍贵。该馆也是中国收藏章太炎先生文物最为丰富的场所。(完)
