戴高乐号的舰体设计十分强调防护能力 ，全舰从飞行甲板至舰底形成一个完整的箱型堡垒式构造，舰岛使用凯芙勒装甲以及轧制钢来强化抗击能力 ；为了避免受损时产生连锁引爆，轮机舱与弹药库周围的舱壁都以装甲强化，并采用前后分散布置，与之相邻的舱房也以装甲舱壁隔开；全舰由19道纵向舱壁划分为20个水密舱区，水线以下的舰体采用双层或多层船壳设计，并锐意强化舰底强度。舰内总共划分为2200个舱室，由舰底到舰桥顶部共15层甲板。戴高乐号拥有完全符合北约标准的核生化防护能力，舰上绝大部分舱室都采用气密式结构，使用加压系统可使舱压高于外界压力，避免核爆尘或生化武器入侵。图为2015年11月18日，法国“戴高乐”号航在土伦母港准备出航。