土地利用和管理政策，在各类功能区的形成和发展过程中将扮演关键的角色
土地是一切空间开发活动的承载体，国土空间格局的形成和优化，最终要通过土地利用方式来体现。《全国主体功能区规划》的颁布实施为实施土地差别化政策提供了重要平台。主体功能区战略与土地政策间关系紧密，二者相互作用，共同促进经济发展方式转变，推动国民经济全面、协调、可持续发展。
按照国家区域发展战略和规划要求，充分利用部省合作平台，对不同区域实行有区别的支持政策。国土资源部先后与东中西多个省(区、市)签订部省合作协议，以部省协议为平台，以规划、计划、审批、供地等为手段，因地制宜，“一省一策”实施差别化的土地管理政策，开展土地管理制度改革，推动主体功能区建设。
优化开发区重在转方式
国家优化开发区域的人口和经济密度大，是带动全国经济社会发展、在更高层次上参与国际分工、提升国家竞争力的重要区域，主要包括环渤海、长三角、珠三角等区域。
优化开发区域的土地利用存在三个突出问题：土地开发利用强度过高，建设用地比例过大，自然状态下的土地资源消耗过快；土地资源利用空间布局不合理，结构有待优化，工业用地过多，土地资源开发利用效益有待进一步提高；人多地少，土地资源稀缺程度高，土地后备资源不足。
在具体的土地政策上，调整各类土地开发利用的结构比例，优化利用的空间布局；严格控制区域内建设用地总量的继续增加，减量供应新增建设用地，加强存量建设用地的二次开发；强化土地生态环境保护的约束，以生产和生态双重要求加强耕地保护，开展高标准基本农田建设。
按照这一政策，国土资源部先后与天津、浙江、广东、上海签订省(市)部合作协议，支持优化开发区域率先调整转变土地利用方式，开展“三旧改造”，存量建设用地更新等为中心的集约节约用地试点，促进这些区域落实优化开发功能，调整优化经济结构，加快转变经济发展方式。
严控建设用地增量，调整建设用地布局和结构。控制建设用地总规模，严格限制新增用地；引导城镇用地布局优化和结构调整。优先保障廉租住房、经济适用住房及普通住宅建设用地；整合优化交通、能源、水利等基础设施用地；合理拓展建设用地新空间。积极引导城乡建设向地上、地下发展，优先使用未利用地，加强滩涂的开发利用。
其次，全面推动存量挖潜，节约与集约并重利用建设用地。按照“严控总量、盘活存量、减少增量、稳定流量”的原则，建立盘活存量建设用地的机制，大力开展拆旧建新，充分利用发挥存量建设用地效益，增加建设用地“流量”。
其三，发挥耕地的多重功能，创新耕地保护激励机制。开展耕地分类分级保护和有偿保护试点，对参与耕地保护的农户和集体经济组织给予补贴，形成耕地分类分级激励保护机制。
其四，防治耕地污染，保护土地生态环境。切实加大耕地污染的防治力度。保留城市间开敞的绿色空间，保护好水系、林网、自然文化遗产等用地，促进区域生态环境改善。
其五，加快农村土地制度改革，促进城乡一体化建设。探索农村集体建设用地所有权实现形式，土地使用权特别是建设用地使用权的流转方式和途径。建立城乡统一的土地交易市场，实现“两种所有权，同一市场”，探索国家、集体、个人的土地利益分配机制，将集体土地收益反哺于农村。
